Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL3Q6DD88 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATL3Q6DD88 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms