Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GARNL3Q5VVW2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms