Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF20Q5VTR2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF20Q5VTR2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms