Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GKAP1Q5VSY0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms