Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BEND3Q5T5X7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BEND3Q5T5X7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms