Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PERM1Q5SV97 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms