Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms