Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAVIN4Q5BKX8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms