Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFT2D3Q587I9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms