Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVEP1Q4LDE5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms