Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRNQ4KMQ1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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