Protein–RNA interactions for Protein: Q495Y8

SPDYE2, Speedy protein E2, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2Q495Y8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDYE2Q495Y8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPDYE2Q495Y8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms