Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP6Q3SY56 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms