Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD55Q3KP44 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD55Q3KP44 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms