Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UVSSAQ2YD98 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms