Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL40Q2TBA0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL40Q2TBA0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms