Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC96Q2M329 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms