Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C17orf58Q2M2W7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms