Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RTL8BQ17RB0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL8BQ17RB0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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