Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UPP1Q16831 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UPP1Q16831 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms