Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NTRK3Q16288 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTRK3Q16288 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms