Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CNGA3Q16281 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNGA3Q16281 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms