Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC85BQ15834 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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