Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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