Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SHBQ15464 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHBQ15464 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SHBQ15464 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHBQ15464 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHBQ15464 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHBQ15464 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHBQ15464 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHBQ15464 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHBQ15464 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHBQ15464 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SHBQ15464 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHBQ15464 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms