Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF4Q15306 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF4Q15306 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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