Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RABEP1Q15276 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RABEP1Q15276 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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