Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKD1Q15139 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRKD1Q15139 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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