Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAM2Q15035 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAM2Q15035 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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