Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERC3Q15034 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERC3Q15034 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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