Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCLAFQ15004 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms