Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
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COL19A1Q14993 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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COL19A1Q14993 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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COL19A1Q14993 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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COL19A1Q14993 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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COL19A1Q14993 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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COL19A1Q14993 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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COL19A1Q14993 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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COL19A1Q14993 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
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COL19A1Q14993 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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COL19A1Q14993 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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COL19A1Q14993 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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COL19A1Q14993 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL19A1Q14993 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
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