Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHD4Q14839 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHD4Q14839 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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