Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RRP1BQ14684 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRP1BQ14684 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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