Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF235Q14590 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms