Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDX39BQ13838 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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