Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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TUBA3CQ13748 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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TUBA3CQ13748 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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TUBA3CQ13748 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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TUBA3CQ13748 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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TUBA3CQ13748 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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TUBA3CQ13748 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TUBA3CQ13748 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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