Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMS2P11Q13670 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms