Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CUL3Q13618 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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CUL3Q13618 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CUL3Q13618 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CUL3Q13618 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CUL3Q13618 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CUL3Q13618 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CUL3Q13618 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CUL3Q13618 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CUL3Q13618 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CUL3Q13618 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CUL3Q13618 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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