Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEUROD1Q13562 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
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