Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDAP1Q13442 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDAP1Q13442 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms