Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
XRCC4Q13426 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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