Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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