Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CBX3Q13185 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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