Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRDNQ13061 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms