Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
STRN3Q13033 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
STRN3Q13033 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms