Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIK3Q13003 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIK3Q13003 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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