Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ELP6Q0PNE2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms