Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C2orf54Q08AI8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C2orf54Q08AI8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms