Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSRP1Q08945 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSRP1Q08945 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms